29th EHA Congress Travel Award 受賞レポート 山﨑 貴弥
名前:山﨑 貴弥【横浜市立大学大学院 医学研究科医科学専攻 免疫学教室】
発表形式:e-poster
Title:
Physical and functional interaction among Irf 8 enhancers during dendritic cell differentiation
Authors:
Takaya Yamasaki, Akira Nishiyama, Nagomi Kurogi, and Tomohiko Tamura
Affiliations:
Department of Immunology, Yokohama City University Graduate School of Medicine, Kanagawa, Japan
Abstract:
Background: Dendritic cells (DCs) are important for both innate and adaptive immunity. One of the classical DC subsets, cDC1s, promote cytotoxic T cell or Th1 responses. Hematopoietic stem cells (HSCs) produce cDC1s via their progenitor cells. We have found that the expression level of IRF8 is critical for the lineage choice. High expression of the transcription factor (TF), IRF8 is required for the cDC1 differentiation. Multiple enhancers often regulate differentiation stage- and cell type- specific expression of single lineage-determining transcription factor genes.
Aims: We and others have reported that three Irf8 enhancers at the 3′ region (+56, +41, and +32 kb) sequentially regulate the Irf 8 expression during cDC1 differentiation. Accordingly, mice lacking the +56 or +32 kb enhancer are deficient in cDC1s. However, whether and how these enhancers interact physically and functionally remains unclear.
Methods: To clarify this issue, we first performed Tiled-C analysis which enabled us to analyze physical interactions in the genomic region of interest at high resolution for the Irf 8 locus. Next, we analyzed functional interaction among the Irf 8 3′ enhancers using +56 Δ/WT and +32 WT/Δ mice which retained the cDC1-lineage cells. In addition, to distinguish the function of these enhancers through a direct cis interaction or a trans mechanism involving TFs including IRF8 itself, we exogenously transduced IRF8 into +56 Δ/Δ and +32 Δ/Δ cells to rescue cDC1 differentiation.
Results: Physical interactions among the Irf 8 enhancers and the Irf 8 gene body became robust upon cDC1 differentiation. Next, by analyzing +56 Δ/WT and +32 WT/Δ mice, we found that the +56 and +32 kb enhancers are each required to fully activate the remaining two 3′ enhancers in the late stage of cDC1 differentiation. H3K27ac levels at the +41 and +32 kb enhancers were recovered in the rescued +56 Δ/Δ cDC1s. In contrast, those at the +56 and +41 kb enhancers were almost absent in the rescued +32 Δ/Δ cDC1s.
Summary/Conclusion: These results indicate that the +56 kb enhancer acts on the other 3′ enhancers through an IRF8-dependent trans mechanism, whereas the +32 kb enhancer through a direct cis mechanism. We will discuss why the +56 and +32 kb enhancers employ distinct ways to cooperate with other enhancers. We believe that our findings are not limited to DC biology and may represent a basic principle for how multiple enhancers physically and functionally cooperate to regulate a critical gene in a cell type- and lineage-specific manner during cell differentiation.
EHA2024参加レポート
この度はJSH-EHA Travel Grant Program for EHA2024に採択いただき,誠にありがとうございます。昨年度と同様にハイブリッド開催の形式となり,e-poster形式で現地にて発表いたしました。
今年度の開催はスペインのマドリードにて行われました。この時期の日本より気温は高いのですが,湿度は低く日陰は涼しいため,日中も快適でした。マドリードは比較的治安の良い印象で,特別な雰囲気を感じることができました。また,地下鉄が発達し,市内のフリーパスもいただけたので,ホテルから会場への移動もしやすかったです。
今回初めての国際学会にて緊張していましたが,学会の雰囲気は日本の血液学会と似ており戸惑うことなく楽しめました。ポスター発表の時間以外は各セッションを拝聴することができ,非常にレベルの高い研究発表に触れることができました。私が基礎研究をしているため,主に基礎系のセッション会場を回りました。その中でも特に造血分野のセッションは非常にハイインパクトな演題で構成されていたことに加え,若手の発表者が多く刺激を受けました。過去に読んでいた論文の著者が発表しており,論文を読んだだけではわからない,その研究者の考えや研究の進め方を感じることができ,現地にて参加できて大変嬉しく思いました。セッション中は適度な緊張感の中,高度な議論が交わされており,次は自分が口頭発表者として参加したいと思いました。
自身の発表内容に関しては,1つの転写因子の発現制御に焦点を当てた基礎研究の内容を発表いたしました。具体的には,IRF8という免疫細胞の中でも単核貪食細胞の分化に重要な役割を果たす転写因子に着目し,樹状細胞が分化する過程において,IRF8発現量を制御するエンハンサーの直接的・間接的な相互作用を解明したことを報告いたしました。多くの発表内容は疾患の治療などに関するものでありながら,交流したヨーロッパの若手医師の方は興味を向けてくださり,いくつかの質問をいただきました。
また,YERM MixerおよびEHA Groovesではヨーロッパの若手医師と交流することができました。最初は英語でのコミュニケーションに抵抗がありましたが,快く受け入れていただけたことで,楽しく交流することができました。ヨーロッパの若手医師を中心としたYoung EHAのコミュニティは非常に仲が良く,交流の機会が多くあることを聞き有意義な場なのではと思います。私も日本にて若手医師・研究者と積極的に交流の機会を作ろうと思っています。
今回のEHAで得られた経験,研究分野からの刺激を糧とし,今後自身の研究のフィールドを病態解析のみならず臨床を視野に入れた研究ができたらと考えています。今回このような貴重な機会をいただき,日本血液学会国際委員会,事務局の皆さまには心より感謝申し上げます。また,日頃よりご指導いただいている田村先生,研究室の皆様にこの場を借りて深く御礼申し上げます。